Program H2020 nabízí pro evropské i mimoevropské vědecké týmy široké možnosti a velké příležitosti mezinárodní spolupráce s významnými evropskými výzkumnými institucemi (tzv. TOP instituce). Za TOP instituce lze považovat takové instituce, které v dosavadním průběhu programu H2020 kontrahovaly nejvyšší finanční podporu z rozpočtu H2020 a jejichž výzkumné týmy se v H2020 účastnily projektů, ve kterých bylo alokováno 51 % dosud vynaloženého rozpočtu na řešení projektů v programu H2020.
Seznam TOP institucí, řazený podle finanční podpory, kterou požadovaly na svoji účast, ukazuje následující tabulka:
